毛花猕猴桃雄株核心种质构建及遗传多样性分析
邹梁峰
【摘要】：毛花猕猴桃(Actinidia eriantha)是猕猴桃属(Actinidia Lindl.)的重要种类之一,是中国广泛分布的特有的种质资源。本研究以收集的207份毛花猕猴桃雄株为试验材料,基于“表型性状+SSR分子标记”进行核心种质构建并对其遗传多样性进行研究,构建了核心种质的DNA指纹图谱。
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主要研究结果如下:(1)在表型水平上构建了毛花猕猴桃雄株初级核心种质。从207份供试毛花猕猴桃雄株种质中最终得到31份初级核心种质,取样比例为14.95%。最佳取样策略为:“欧氏距离+多次聚类优先取样法+类平均法+15%的取样比例”,极差符合率(CR)、变异系数变化率(VR)、表型保留比例(RPR)和Shannon多样性指数(H)分别为97.98%、130.54%、100.00%和1.78。对11个性状遗传多样性指数进行t检验,除了花粉活力存在显著差异外,其他性状均差异不显著,主成分分析也发现初级核心种质能很好的代表原始种质。基于遗传多样性t检验中花粉活力存在显著差异,于是对初级核心种质进行补充,使初始核心种质变为44份。(2)在分子水平上构建了毛花猕猴桃雄株核心种质。44份毛花猕猴桃雄株种质基于稀有等位基因优先取样法达到26份核心种质,取样比例为59.09%。44份初始核心种质在23个SSR位点扩增的等位基因数(n)、平均等位基因数(Na)、平均有效等位基因数(Ne)、平均Shannon多样性指数(I)、平均期望杂合度(He)、平均Nei's遗传多样性指数(H)和平均多态信息含量(PIC)分别为:241、10.4348、5.7512、1.8647、0.7814、0.7716和0.778。26份核心种质对应的以上参数分别为234、10.087、6.104、1.916、0.810、0.792和0.796。核心种质等位基因保留比例和表型保留比例为97.10%和97.92%,剔除了原始种质中的遗传冗余,使部分遗传多样性参数有所提高,构建的核心种质代表性较好。(3)利用SSR分子标记对26份毛花猕猴桃雄株核心种质进行遗传多样性分析及聚类分析,并构建其DNA指纹图谱,以期为猕猴桃分子辅助育种奠定基础。进行毛花猕猴桃雄性资源核心种质的遗传多样性分析及分子指纹图谱的构建。对23条引物的扩增结果进行多态性分析,结果表明26份核心种质共扩增出234条DNA条带,其中多态性条带为234条,多态性条带比率100%。扩增条带数最多的引物是UDK99-143,达21条,扩增条带数最少的引物是22,仅6条。SSR引物多态信息含量PIC值为0.480-0.935,平均多态信息含量为0.796。从23条引物中最少需要2对多态性引物(UDK99-143和A055)可以完全区分供试种质,同时构建了分子指纹图谱,使每份种质均得到唯一的DNA分子指纹。构建的核心种质树状图可将核心种质分为八大类。
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